Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bnc1O35914 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms