Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pik3cdO35904 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms