Protein–RNA interactions for Protein: O35900

Lsm2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm2O35900 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lsm2O35900 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lsm2O35900 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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