Protein–RNA interactions for Protein: O35855

Bcat2, Branched-chain-amino-acid aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcat2O35855 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bcat2O35855 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bcat2O35855 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms