Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cited2O35740 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cited2O35740 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cited2O35740 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms