Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NudcO35685 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NudcO35685 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NudcO35685 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NudcO35685 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NudcO35685 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NudcO35685 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NudcO35685 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NudcO35685 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NudcO35685 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NudcO35685 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NudcO35685 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NudcO35685 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NudcO35685 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NudcO35685 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NudcO35685 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NudcO35685 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NudcO35685 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NudcO35685 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NudcO35685 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NudcO35685 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NudcO35685 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NudcO35685 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NudcO35685 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NudcO35685 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NudcO35685 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NudcO35685 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NudcO35685 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NudcO35685 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NudcO35685 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NudcO35685 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NudcO35685 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NudcO35685 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NudcO35685 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NudcO35685 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NudcO35685 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NudcO35685 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NudcO35685 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NudcO35685 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NudcO35685 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NudcO35685 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NudcO35685 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NudcO35685 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NudcO35685 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NudcO35685 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NudcO35685 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NudcO35685 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NudcO35685 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NudcO35685 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NudcO35685 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NudcO35685 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NudcO35685 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NudcO35685 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NudcO35685 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NudcO35685 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NudcO35685 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NudcO35685 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NudcO35685 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NudcO35685 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NudcO35685 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NudcO35685 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NudcO35685 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NudcO35685 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NudcO35685 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NudcO35685 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NudcO35685 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NudcO35685 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NudcO35685 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NudcO35685 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NudcO35685 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NudcO35685 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NudcO35685 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NudcO35685 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NudcO35685 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NudcO35685 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms