Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn6O35646 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Capn6O35646 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Capn6O35646 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Capn6O35646 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms