Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag2O35638 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Stag2O35638 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag2O35638 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Stag2O35638 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms