Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RaxO35602 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RaxO35602 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RaxO35602 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RaxO35602 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RaxO35602 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RaxO35602 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RaxO35602 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RaxO35602 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RaxO35602 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RaxO35602 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RaxO35602 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RaxO35602 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RaxO35602 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RaxO35602 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RaxO35602 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RaxO35602 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RaxO35602 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RaxO35602 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RaxO35602 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RaxO35602 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RaxO35602 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RaxO35602 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RaxO35602 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RaxO35602 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RaxO35602 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RaxO35602 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RaxO35602 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RaxO35602 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RaxO35602 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RaxO35602 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RaxO35602 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RaxO35602 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RaxO35602 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RaxO35602 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RaxO35602 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RaxO35602 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RaxO35602 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RaxO35602 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RaxO35602 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RaxO35602 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RaxO35602 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RaxO35602 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RaxO35602 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RaxO35602 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RaxO35602 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RaxO35602 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RaxO35602 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RaxO35602 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RaxO35602 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms