Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccrl2O35457 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms