Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppt2O35448 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms