Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn1O35350 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn1O35350 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capn1O35350 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Capn1O35350 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms