Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2O35245 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2O35245 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms