Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad6O35182 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad6O35182 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad6O35182 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smad6O35182 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad6O35182 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad6O35182 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smad6O35182 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms