Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Eftud2O08810 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Eftud2O08810 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms