Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
MsmbO08540 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
MsmbO08540 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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