Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms