Protein–RNA interactions for Protein: K9J7E2

Gm4312, Predicted gene 4301, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4312K9J7E2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm4312K9J7E2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm4312K9J7E2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms