Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm2056J3QQ02 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms