Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2035J3QP87 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms