Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5294J3QP53 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms