Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Smim18J3QNP2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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