Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm21976J3QNN2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms