Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3336J3QMQ6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm3336J3QMQ6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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