Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930544D05RikJ3QK56 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms