Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn34c3J3QJW5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms