Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm21060J3KMU4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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