Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21897J3KMP5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms