Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20828J3KMI7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms