Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Taf4bG5E8Z2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms