Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubgcp6G5E8P0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tubgcp6G5E8P0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tubgcp6G5E8P0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms