Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SprtnG3X912 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SprtnG3X912 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms