Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Speer4cG3UXD1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms