Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r39G3UWE6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms