Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vmn1r167G3UW71 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Vmn1r167G3UW71 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Vmn1r167G3UW71 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Vmn1r167G3UW71 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Vmn1r167G3UW71 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Vmn1r167G3UW71 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r167G3UW71 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Vmn1r167G3UW71 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r167G3UW71 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Vmn1r167G3UW71 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Vmn1r167G3UW71 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Vmn1r167G3UW71 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r167G3UW71 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r167G3UW71 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r167G3UW71 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r167G3UW71 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r167G3UW71 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Vmn1r167G3UW71 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r167G3UW71 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r167G3UW71 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r167G3UW71 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r167G3UW71 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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