Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn34aG3UW52 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn34aG3UW52 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms