Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colca2F8VPY8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms