Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5160F8VPN3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5160F8VPN3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5160F8VPN3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5160F8VPN3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5160F8VPN3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5160F8VPN3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5160F8VPN3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5160F8VPN3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5160F8VPN3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms