Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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H2-M1F7CXU4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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H2-M1F7CXU4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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H2-M1F7CXU4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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H2-M1F7CXU4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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H2-M1F7CXU4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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H2-M1F7CXU4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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H2-M1F7CXU4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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H2-M1F7CXU4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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H2-M1F7CXU4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M1F7CXU4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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