Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm28048F7BCN0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm28048F7BCN0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm28048F7BCN0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm28048F7BCN0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Gm28048F7BCN0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28048F7BCN0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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