Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm8005F6YKY3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Gm8005F6YKY3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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