Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Igkv1-99F6XWB2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Igkv1-99F6XWB2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms