Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Crocc2F6XLV1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Crocc2F6XLV1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms