Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Gm5861F6VCN9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5861F6VCN9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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