Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atf6F6VAN0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
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