Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933403O08RikF6UK53 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms