Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm28374F6SG70 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm28374F6SG70 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm28374F6SG70 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm28374F6SG70 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm28374F6SG70 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28374F6SG70 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28374F6SG70 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28374F6SG70 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28374F6SG70 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28374F6SG70 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28374F6SG70 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28374F6SG70 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28374F6SG70 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28374F6SG70 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28374F6SG70 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm28374F6SG70 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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