Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syngap1F6SEU4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syngap1F6SEU4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms