Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930451I11RikE9Q9R3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms