Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd35E9Q9D8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ankrd35E9Q9D8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ankrd35E9Q9D8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ankrd35E9Q9D8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ankrd35E9Q9D8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd35E9Q9D8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd35E9Q9D8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd35E9Q9D8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd35E9Q9D8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd35E9Q9D8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms